Além do aspecto assistencial, desde 2007, o departamento conta também com programa de residência em Medicina Nuclear com duração de 3 anos, que é credenciado pelo MEC e possui cinco vagas anuais. Nesse período, o médico residente desenvolve atividades teóricas, direcionadas ao estudo dos conceitos físicos e fisiopatológicos que envolvem a especialidade, e práticas, que compreendem manipulação de radiofármacos, participação em cirurgias radioguiadas (especialmente na pesquisa de linfonodos sentinelas), elaboração de laudos e administração de radioisótopos para tratamentos. As atividades são supervisionadas em tempo integral pelos 5 médicos preceptores especialistas em Medicina Nuclear, sendo dois deles com titulação de doutorado e um mestre.
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