As equipes de TMO adulto e pediátrico dispõe também de 2 vagas por ano para residência médica, com duração de 12 meses. O programa tem como objetivos: capacitar o profissional médico nos atendimentos de todas as fases do transplante (pré, durante e pós-TMO); preparar o residente para indicar e contraindicar o procedimento corretamente; busca capacitá-lo para reconhecer as principais complicações e iniciar rapidamente os tratamentos específicos; busca desenvolver o olhar do profissional para o longo prazo para que sejam adotadas medidas preventivas que possibilitem a melhora da qualidade de vida dos pacientes; e capacitá-lo quanto a avaliação dos doadores para que possam ser realizados procedimentos de coleta de CTH.
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